首都医科大学附属北京儿童医院新生儿外科已成为评价小儿外科水平的一个重要标志。医院外科新生儿专业创建于1972年，专业发展至今已有近50年。成功救治了大批新生儿外科疾病患儿，在国内成功的进行了首例联体儿分离术，率先开展了新生儿期巨结肠根治术、新生儿期中位无肛骶会阴肛门成形术、新生儿期腹腔镜手术如巨结肠根治术、幽门环肌切开术等，目前本专业在国内处领先水平。本专业拥有主任医师4人，副主任医师1人，主治医师1人，住院医师6人。博士生导师1人，硕士生导师2人，博士3人、硕士6人。临床和科研技术力量雄厚。大量的进修医生都成为当地医疗技术骨干和学术带头人。在诊断和治疗新生儿外科疾病方面具有丰富的临床经验及良好的治疗效果，诊治患儿数量国内居首，抢救了无数危重的新生儿患者并获得良好的生活质量。先天性食管闭锁并气管食管瘘的治疗代表新生儿外科的技术水平，目前对于本病的抢救及治疗成功率很高。每年收治新生儿巨结肠近百例，近10余年来广泛应用腹腔镜及经肛门路径治疗新生儿期巨结肠，手术打击明显减小，术后恢复很快，切口疤痕微小，随访效果良好，深受患儿家长欢迎；对腹壁裂、脐膨出的治疗效果处国内领先水平；对于各种消化道先天性畸形的治疗及产前咨询有着大量的经验；先天性膈疝的治疗有着很高的治愈率。本专业还开展小儿胃肠功能监测检查，如胃食管反流等疾病的24小时食管pH监测，小儿便秘的肛门直肠测压检查，为一些疾病的临床诊断提供了有效的帮助，对于先天性疾病有系统长期的诊疗经验，对于各种术后并发症的处理，以及患儿远期生活质量的评估有长年的经验。进年来，针对早产极低体重重症患儿的外科治疗也获得了重大进展，围手术期的外科治疗取得了长足的进步。新生儿期疾病发病紧急，患儿体质弱小，为方便患儿就诊，我专业保证每日均有专业人员门诊出诊，并与院内相关科室之间有着良好的协作关系，可以确保危重患儿及时得到救治，对于产前发现的先天性畸形可以提供咨询和指导，并开通产后治疗的绿色通道，使患儿出生后能够及时获得有效的诊治。