北京大学第一医院康复医学科始建于1950年，当时称为理疗科。1986年随着康复医学在国内的兴起，科室名称改为物理医学与康复科。2012年再次更名为目前的康复医学科，它属于临床科室。
康复医学是上世纪八十年代在我国逐渐发展起来的一个新兴学科，近30年来，在院领导的重视和关怀下，康复医学科从小到大，从简陋到完善，逐步发展成为目前具有先进康复评定和康复治疗技术与设备、覆盖多种系统疾病、门诊与病房相结合的康复医学科，可以高标准、高效率地促进功能障碍患者的康复进程。
尤其进入21世纪后，康复医学科在科室规模、人员素质，以及医、教、研水平和社会影响力等方面均处于国内本专业领先水平，综合实力强。
康复医学科现有一支精干的医师和治疗师队伍。在脑卒中康复、高危儿监测与管理、儿童发育迟缓与脑性瘫痪康复、肌肉骨骼疾病康复、关节置换术后康复、心肺康复等方面不仅处于国内先进水平，而且通过多次举办国际交流和培训计划，与当今国际领先水平相接轨。