北京大学第一医院眼科是医院最早建立的重点科室之一，早在1915年医院成立之初就创建了眼科，历史悠久，积淀深厚。1978年成为全国首批博士研究生授权点，1986年率先成立了国内第一个小儿眼科。2001年成为教育部重点学科。2009年成为国家教育部视觉损伤与修复重点实验室。2008年与哈佛大学医学院Schepens眼科研究所建立合作关系。经过60多年的发展和几代眼科专家的努力，已经发展成专业齐全、医教研并重、处于国内领先地位的优势科室。设有青光眼，葡萄膜炎、眼底病、角膜病、斜弱视等专业，专业设置较齐全。其中青光眼、葡萄膜炎、角膜病专业组均属国内一流水平。