北京海淀妇幼保健院优生咨询产前筛查起源于1992年设立在妇保科内的遗传实验室，历经30年的发展、演变，现已成为北京海淀妇幼保健院的重点科室之一，是北京市9家产前诊断中心之一。

目前中心包括以下专业：产前筛查门诊、产前诊断门诊、优生遗传咨询门诊、遗传实验室、产前诊断手术室、超声科、营养门诊、放射科。科室分布于保健院本部和东南院区。主要服务业务包括无创产前检查（NIPT））、单基因遗传病筛查（耳聋、SMA、地中海贫血等）、超声筛查（早孕期、中孕期）、介入性产前诊断（绒穿、羊穿、脐穿等）、超声产前诊断、遗传咨询、优生生育咨询、复发性流产咨询等。

现有医务人员60名，其中主任医师7人，副主任医师9人，博士研究生4名，硕士研究生12名。