北京大学第三医院康复医学中心（康复医学科），于1992年8月由北京大学运动医学研究所康复组及北京大学第三医院理疗科合并成立，至今已30年。

目前，康复医学中心拥有51名职工，其中主任医师4人，副主任医师4人，主治医师7人，住院医师2人；主管治疗师7人，治疗师23人；主管护师3人，护师、护士8人。

康复医学中心坚持以骨科、运动创伤康复为特色，神经、心肺康复全面发展。历届科领导把握机遇，努力促进学科发展并取得了丰硕成果。

2013年，康复医学中心获原卫生部国家临床重点专科建设项目。2016年，康复医学中心成为国家级康复医学质控中心。2021年，康复医学中心成为北京市康复医学质控中心，国家重点规培基地。在复旦医院管理研究所康复医学中心专科排名中，康复医学中心2017-2021年排名均为全国第7名。