石河子大学第一附属医院普外科，是该院重点科室。乳腺肿瘤、胃肠道肿瘤、血管疾病及肛周疾病的诊疗是该科特色，在门诊大楼设有该科专家门诊、肛肠门诊及乳管镜门诊。该科室共有医护人员29人，全科现有博士2人，硕士11人，科室现有固定床位58张，开放床位60张。

乳腺肿瘤：该科以乳腺癌根治术为基础，严格把握适应症开展乳腺癌的前哨淋巴结活检术、保乳手术及乳腺重建术。

胃肠肿瘤：在实施消化道肿瘤根治术方面，以结直肠癌根治术为主，开展腔镜下结直肠癌根治术、直肠癌的低位保肛术，降低手术创伤，提高保肛率，并结合自主神经保护，明显提高患者生存质量。

血管外科：包括动脉瘤的瘤体切除术、人工血管置换术、腔内血管支架植入、动脉栓塞的动脉导管取栓术及动脉置管溶栓术、下肢深静脉置管溶栓术、下腔静脉滤网植入术、颈内动脉内膜剥脱术等。

同时，对于恶性肿瘤，该科有着几十年的综合治疗经验，规范按照指南进行恶性肿瘤的放化疗、新辅助放化疗、内分泌治疗、靶向治疗，并能熟练的处理各种综合治疗的并发症。