新疆医科大学第二附属医院心胸外科组建于上世纪五十年代建院初期，有60多年的历史，是自治区临床重点专科。由同一技术队伍承担着胸外科、心外科两个专业的临床工作，2014年经自治区批准为我院第一批自治区重点专科。

亚专科技术水平方面已形成特色，技术能力强，人员构成合理，编制床位18张，有主任医师2人，副主任医师2人，主治医师3人，优势病种如：胸部创伤、纵膈疾病、肺疾病、食管疾病等微创手术治疗达到了国内先进水平，先心病微创介入治疗、冠脉搭桥手术、心脏瓣膜置换手术、动脉夹层介入治疗等在疆内具有明显优势，学术成果：国家级自然科学基金项目1项，自治区级自然基金课题3项。