中西医结合科始建于1954年，当时只开中医门诊2间，到1981年2月医院正式成立住院部。经过近70年每代中医人的传承与努力，科室不断发展壮大，由最初的10张病床发展到现40余张编制病床，并常年加床收治患者，目前已发展成集临床、教学和科研为一体的重点科室；人才队伍从最初几个人，壮大到现在拥有医护人员33人，其中主任医师3人（沙剑轲主任曾荣获云南省名中医，全国中医临床优秀人才，现任云南省第五批中医药师带徒指导教师；黄河涛、刘俊荣获云南优秀青年中医）、副主任医师3人（王国强荣获云南省中医药学科带头人）、主治医师8人，住院医师2人，主任护师1人，副主任护师1人，主管护师4人，护师6人，护士5人。所有医师均具有丰富的中西医诊治内外科疾病及康复治疗的能力。科室自成立以来，就开展肛肠病、中医内科、妇科、儿科、风湿病、老年病、皮肤病等常见病及部分疑难病种的中西医诊疗，特别是中医肛肠疾病诊治能力在昭通地区处于领先。科室现在分门诊部、住院部，门诊开设中医肛肠（痔、漏、痈等）普通、专家门诊，中医内科专家门诊，中医特色门诊（中医内科、针灸理疗等）；住院部收治中医肛肠及中医内、妇、老年病、皮肤病患者。科室致力于中医经典学说和中医基础理论的研究，重点发展中医中药事业，是集中医医疗、传统康复、养生保健、治未病于一体的特色科室，科室倡导系统化和个体化的综合康复理念，秉承弘扬中医文化，传承民族精神，承担妇幼责任，为广大人民群众提供更多服务，现科室开展有针灸、推拿、拔罐、艾灸、中药面膜、中药熏蒸、中药足浴、中药封包、中药塌渍、放血疗法、穴位埋线、揿针、耳针等多个治疗项目。科室还着力于自主药物的研发，如院内制剂“四黄膏”深受肛肠患者好评。科室先后在省级和国家级医学杂志发表论文约数十篇，获市级科技进步奖4项，现立项1项。获得省民族医药资助项目1项，首届全国综合医院中医药工作示范单位、云南省昭通市中医“治未病中心”。成为拥有预防、医疗，教学，科研能力为一体大科室。  开展诊治范围：中医肛肠：中医肛肠急危重病：肛周坏死性筋膜炎、重度感染肛周脓肿、藏毛囊肿伴脓肿、直肠脱垂、肛门直肠出血并重度贫血等。中医肛肠常见病：普通肛瘘、复杂肛瘘、混合痔、环状痔、肛周脓肿、直肠粘膜下脓肿、肛裂、肛周瘙痒、肛乳头纤维瘤，各种疔、痈、疖肿等疾病的手术、非手术治疗。未来拟开展盆底疾病康复治疗，肛门测压，生物反馈治疗等，对便秘患者、不明原因肛门痛患者、盆底肌松弛导致漏尿、漏便患者、脱垂患者都是一种不错治疗选择。中医内科：1、各种外伤、心脑血管疾病恢复期的中西医康复治疗、康复训练。2、老年性疾病、慢性病（高血压、糖尿病、腰椎间盘突出、骨质增生、腰腿痛、眩晕、失眠、脑梗塞、中风、耳鸣、面瘫、风湿性关节炎、类风湿性关节炎、骨关节炎、痛风、小儿脑瘫、慢性阻塞性肺疾病、肺炎、咳嗽、咽喉炎、甲状腺代谢性疾病、尿路感染）。3、皮肤病（湿疹、过敏性皮炎、带状疱疹、荨麻疹、牛皮癣、银屑病）。4、消化系统疾病（慢性胃炎、胃溃疡、肠炎、腹胀、便秘等中西医诊治）及部分妇科病、儿科病的中西医诊治。