南方医科大学深圳医院儿科包括儿科门急诊、儿童保健门诊、普通儿科病房、深圳宝安区“地贫之家”诊疗中心等。科室现有主任医师7人，副主任医师2人，主治医师9人，住院医师1人。儿科主任张玉明来自南方医科大学南方医院。
目前我科开展诊治各种普儿科常见病多发病、疑难疾病等，包括小儿血液系统疾病（如白血病、淋巴瘤、地中海贫血、血友病等）及遗传代谢性疾病，呼吸系统疾病（如支气管哮喘、慢性咳嗽、反复呼吸道感染等），内分泌疾病（性早熟、矮小症等）；开展各种儿童危重症急救技术如各种呼吸支持、支气管镜下肺泡灌洗术等；儿童保健如儿童健康体检、神经系统发育评估、康复治疗，生长发育、营养、行为与气质等。