陕西中医药大学第二附属医院泌尿外科是西咸新区区域内规模最大、设备最为先进齐全、技术力量最为雄厚的泌尿外科专科，现为陕西中医药大学泌尿外科硕士研究生授予点、陕西省住院医师泌尿外科规培点，获得国家新药临床试验机构资质。陕西省泌尿外科学会会员单位、西安市医学会男科分会副主委单位、咸阳市泌尿外科学会副主任委员单位、中华中医学会男科分会常委单位。

科室现由西咸院区及秦都院区两个泌尿外科门诊、西咸院区病区、男性检查治疗室、尿动力学检查室、尿道膀胱镜检查室、体外碎石中心组成，病区开放床位44张。形成了由前列腺疾病的微创手术治疗、泌尿系结石的微创手术治疗、泌尿系肿瘤的腹腔镜手术治疗、男科病的中西医结合特色治疗四个亚专业为主导，同时开展的单孔微通道鞘状突高位结扎术、女性压力性尿失禁、显微镜精索静脉结扎术、尿道下裂成形术等手术也特色鲜明，广受好评。

已逐渐发展为区域内亚专业分类最全、设备配套最为先进完善、技术力量雄厚、特色鲜明的泌尿外科专科。