深圳市儿童医院新生儿科成立于1999年，与儿童医院同步发展壮大；于2007年、2011年获批深圳市卫计委优势医学重点专科，2017年被授予深圳市危重新生儿救治中心，2024年纳入广东省临床重点专科建设单位。依托深圳市儿童医院各专科雄厚的技术实力，新生儿科成为集新生儿内、外科、危重新生儿监护、新生儿筛查一体的新生儿医学中心，与心脏外科、神经外科、新生儿普通外科、耳鼻喉科、口腔科、骨科等多个科室合作，开展多项复杂性先天性心脏、颅脑疾病、新生儿先天畸形、难治性坏死性小肠结肠炎等复杂外科手术围手术期救治工作，特别是耳鼻喉科声带麻痹的声带外展手术治疗、口腔科皮罗综合征的下颌骨牵引手术等在国内有较大影响力。新生儿科团队先后主持科技部863项目、国家自然基金重点项目、国家自然基金面上（青年）项目、省部级项目、深圳市科创委重点项目等多项科研基金。共发表论文300多篇，其中SCI论文100余篇；主编、参编著作多部。科室目前开设病床90张（其中NICU 70张），场地面积约2000余平方米，科室诊疗水平属于国家NICU三级C等最高标准。每年通过新生儿转运系统转入危重患儿近千人次，覆盖整个华南片区，国内首次开展主动亚低温转运病人。新生儿科目前拥有专科医生24名，其中博士6名、硕士17名，正高5名、副高6名，博士研究生导师1名、硕士研究生导师5名、博士后合作导师1名。科室护士近百名。新生儿科设备齐全，设有监护仪150台，有创含高频震荡呼吸机21台，CPAP、BiPAP、NIPPV和无创高频等无创呼吸机16台，NO治疗仪6台，脑氧监护仪5台，亚低温治疗仪4台，以及床边脑电图监测设备20台，纤支镜1套，CRRT 1台，ECMO 1台等各种救治设备。科室建立新生儿神经危重症早期诊治和系统化干预；出生缺陷疾病的早期诊断、精准治疗及遗传咨询；极早/超早产儿综合救治；外科危重症的围手术期管理的四大亚专科，各亚专科协同发展，稳步提高医疗质量。每年收治各类新生儿病例2000多例，以危重病例、疑难病例、早产儿、先天性疾病为主，每年收治极低出生体重儿100多例。新生儿科不断开展临床新技术，整合全院技术力量，开展24小时全天候的危重新生儿院前转运，开展各种呼吸管理、吸入一氧化氮、亚低温、血液净化（CRRT）、体外膜肺氧合（ECMO）等先进救治技术，开展各种新生儿外科手术；住院新生儿病死率明显下降，极低出生体重儿存活率达到国内先进水平。并开设新生儿专科和新生儿随访门诊。重视护理学科建设，紧跟医疗发展步伐，增设特色专科护理服务：如超声引导下的新生儿PICC置管与维护、脐动静脉置管与维护、外周动静脉同步换血术、有创动脉血压监测、新生儿鼻空肠置管、早产儿发展性照顾、袋鼠式护理、家庭参与式护理，开设新生儿护理咨询门诊，针对特殊疾病患儿特别是肠造口、带胃管出院、带气管切开出院，特殊皮肤疾病如先天性皮肤缺如等开展出院前指导、延续性护理、家庭访视。科室目标：以呼吸重症、循环重症为基础，神经重症为主要特色的新生儿诊疗中心。科室愿景：粤港澳大湾区一流的新生儿医学中心；华南区婴幼儿脑损伤救治基地。