深圳市南山区人民医院肛肠外科2000年成立，是深圳市所有综合医院第一家独立成科肛肠外科，目前我科有副主任医师3名，主治医师5名，常设床位35张，年门诊量在20000以上，在深圳肛肠外科处于前列，在全市同行中有较高的专科影响力，开科二十年来一直是我市其它医院开设肛肠科观摩学习的样板，也是我市疑难病例会诊、手术的主要平台之一。

科室开展了肛肠科除恶性肿瘤以外的所有手术如肛旁肿物切除、肛周囊肿剥除术、大肠息肉摘除术、内痔注射术、肛管外伤清创术、直肠异物取出术、肛窦切开术、肛乳头切除术、肛周化脓性汗腺炎并感染窦道切开术、肛周脓肿根治术、肛周脓肿切开引流术、肛周脓肿低位切开+高位挂线术、肛周坏死性筋膜炎切开清创引流术、复杂性肛瘘切除术、高位肛瘘低位切开+高位挂线术、肛瘘切除术、内痔自动套扎术、血栓外痔切除术、血栓外痔剥离术、痔切除术、肛裂切除术、藏毛窦炎切开引流术、经阴道直肠前突修补术、直肠粘膜脱垂悬吊固定+硬化注射+肛门紧缩术、PPH术（吻合器痔上粘膜环切术）、直肠脱垂PPH术、直肠阴道瘘修补术、三度会阴撕裂修补术、肛门直肠狭窄瘢痕松解术、肛门成形术等。

科室对便秘、慢性结直肠炎及溃疡性结肠炎等大肠内科疾病的诊治有较多研究和经验。