西南医科大学附属医院血液内科成立于1979年，是四川省最早设立的血液病专科之一，经过40多年的发展，现已成为专业全面、技术精良、经验丰富、梯队完整的西南地区最具实力的血液病治疗中心之一，是省内四个造血干细胞移植中心之一，是川黔滇渝结合部专业技术最强，规模最大的血液病专科，为硕士学位授予点。已授牌中华骨髓库造血干细胞采集/移植备案医院。综合诊疗水平在省内外处于领先水平。

已开展全相合异基因造血干细胞移植、单倍体异基因造血干细胞移植、自体外周血造血干细胞移植。血液内科是集血液内科、中毒救治中心为一体的临床科室，编制床位75张，专科层流病房5间，及一个拥有流式细胞仪、荧光定量PCR仪、造血干细胞分选仪、二代测序、红细胞寿命测定仪、血栓弹力图等现代化设备的专科实验室。承担国家自然科学基金及省市重点科研项目多项，在国内外发表论文百余篇。