成都医学院第二附属医院感染科设置有普通感染门诊、艾滋病门诊、肝病门诊、发热门诊和腹泻门诊。

目前专科医生11名，护理人员13人，高级职称2人，中级职称7人，硕士研究生10人。编制床位25张，年门诊量2万余人，年出院1000余人次。

是华西医院感染性疾病和肝病联盟单位，成华区感染性疾病质控中心。诊治范围包括全身各系统感染性疾病（细菌、真菌、病毒、寄生虫等），各种耐药菌复杂感染、法定传染病、疑难肝病、结核病、艾滋病及合并机会性感染等。

本科是成都市定点收治HIV/AIDS患者，丙肝感染等特殊人群定点治疗机构，已开通该人群重大疾病特殊门诊，方便快捷的为患者服务。