南方医科大学珠江医院感染疾病科主要诊治急慢性乙型、丙型、甲型肝炎、戊型肝炎、肝硬化、黄疸、肝功能异常、发热、流感、新冠感染、急慢性腹泻、季节性传染病及各种感染和传染性疾病，是常见、突发及新发传染病诊治的重要学科。主要开设肝炎门诊、发热门诊、感染门诊、肠道门诊，年门诊量达5万人次。
感染疾病科是内科学（感染病学）研究生培养点、国家级临床医师规范化培训基地（感染病学）、南方医科大学第二临床学院传染病教研室、国家药物临床试验（GCP）基地、广州市医保局“慢性乙型、丙型病毒性肝炎”医保门诊特定项目的指定诊疗科室、广州市海珠区“丙肝治疗定点医院”指定诊疗科室，拥有Fibrotouch剪切波组织定量超声诊断仪、床旁超声机等先进仪器。
与检验医学科合作，实现了新冠抗原检测，流感抗原检测，肺炎链球菌抗原检测，肺炎支原体抗原检测等检测项目的前置检测，患者可以在20分钟内完成检测。
感染疾病科医疗团队在科主任的带领下，掌握国内外最新医疗动态，运用国内先进的诊疗技术和治疗方法，使患者得到准确的诊断和最优的治疗；尤其在乙型、丙型病毒性肝炎、复杂难治性感染的诊治方面拥有丰富的临床经验。科室主持及参与多项国家及省、市、区级科研课题项目和教学改革项目。
承担医学本科生、研究生的传染病学及抗菌药物合理使用的教学任务，开展PBL教学实践；承担进修医师、住院医师规范化培训医师的培养指导工作。多年来始终坚持医、教、研齐头并进发展，全方位持续提高科室的综合实力。
对肝病，尤其是各种病毒性肝炎，应用规范的治疗理念，正规系统治疗了大量的肝炎患者，积累了丰富的临床经验，根据患者不同的血清学、病毒学、生化学等临床特点，制定既经济又有效的最佳治疗方案，形成了个体化治疗的医疗特色，疗效显著，大多数接受治疗的急、慢性肝炎患者肝功能短期内恢复正常，病情长期稳定，部分患者甚至实现了HBsAg阴转的理想目标。
在发热性疾病的诊断治疗方面做到规范化，对不明原因发热、季节性流行性感冒、甲型H1N1流感等发热性疾病有着丰富的诊疗经验和良好的治疗效果。