牡丹江医学院附属第二医院胸外科为医院重点科室，擅长肺部、食管、纵膈、胸部损伤等疾病的诊治，尤其善于胸腔镜微创治疗肺癌、肺小结节病变、气胸、恶性胸水等治疗。微创胸腔镜治疗以单孔腔镜操作为主，更好的减少了患者的创面，促进患者更快的恢复。

科室针对目前高发的肺小结节病变，开展了三维重建动态观察检测技术，提高了肺小结节病变的诊断与手术成功率。并与上海相关科研机构合作开展了肿瘤靶向治疗需要的基因检测，能够更好的指导肿瘤患者术后的靶向治疗与化疗。