中山大学附属第三医院口腔科（口腔医学部）是一个成熟的综合性口腔医疗中心，设有牙体牙髓科、牙周科、口腔颌面外科、正畸科、修复科等五大专科，是广东省临床重点专科，2019年被评为“广东医院最强科室”之一。
本部同时拥有全国住院医师规范化培训口腔全科、口腔正畸专业基地、口腔正畸学专业博士点、口腔正畸学博士后流动站。目前共有医生63名，护士52名，其中副主任医师以上职称19名，具有博士学位人员16名。

目前已开展多项临床新技术，如显微镜下复杂根管治疗，显微根尖手术，化学微创去腐，各类型膜龈手术，PAOO，数字化种植导板以及数字化矫治技术等，可多学科联合治疗各种类型疑难病例，为患者提供微创、精准的医疗服务。