广州中医药大学第一附属医院脑病科是广东省中医临床重点专科，广州市卒中急救地图医院，中国中医药信息学会脑病分会副会长单位，世界中医药联合会脑病专业委员会常委单位，中国中医药学会感染病专业委员会副主任委员单位，广东省中西医结合学会感染病（热病）专业委员会主任单位，广东省中医药学会脑病分会副主任单位，广东省保健协会脑卒中防治与康复分会主任委员单位。
1988年，在老一辈温病学家刘仕昌、彭胜权等教授的倡导和带领下，广州中医药大学温病学教研室在全国率先回归临床，开设脑病科（当时名为四内科病区）。2003年成为广东省中西医结合脑病重点专科，2012年2月成为国家中医药管理局“十二五”重点专科建设项目。
科室有医教研人员15名，其中正高级职称6名，副高级职称4名；博士生导师2名，硕士生导师4名；全国名老中医学术思想继承工作指导老师1名、广东省名中医2名。床位48张。年门诊量7万人次左右，年出院量约1300人次。
脑病科是国家重点学科“中医临床基础”的重要组成部分，有2个主攻临床方向，即神经内科（脑病专科）和热病专科。脑病专科收治疾病的类型包括脑血管病、神经系统感染免疫性疾病、脱髓鞘疾病、变性性疾病、营养代谢性疾病、神经肌肉病变、周围神经病变及功能性病变等类型。
常见的病种有脑梗塞、脑出血、蛛网膜下脑出血；脑炎及脑膜炎、急性脊髓炎、视神经脊髓炎；多发性硬化、格林巴利综合症、帕金森病、舞蹈病、癫痫、肌萎缩侧索硬化、肌营养不良、周期性麻痹、面神经炎、多发性肌炎及皮肌炎以及头痛、头晕、焦虑症等。中医优势病种和临床路径有中风、眩晕、痫病、颤病、痿病，痿症6种。热病专科主要收治系统性红斑狼疮、各系统感染和免疫性发热及不明原因发热等病种。
主要设备技术：开展了24小时长程视频脑电图、睡眠监测、眼震地图检查、急性脑梗塞溶栓、脑血管造影以及介入治疗技术。