南方医科大学（原第一军医大学）南方医院儿科于1955年（解放军216医院时期）正式建科至今，集医疗、教学、科研为一体，综合实力位居广东省前列，是广东省临床重点专科、博士学位授予点、国家住院医师规范化培训基地。设有儿童肾脏亚专科、儿童血液亚专科、儿童风湿免疫亚专业、儿童呼吸亚专业和儿童重症亚专业。以儿童肾脏病、儿童白血病、造血干细胞移植、儿童实体瘤为其主要专科特色。

南方医院儿科从1985年建成儿科造血干细胞移植中心，是华南地区最早开展造血干细胞移植的单位。已成功将干细胞移植应用于血液系统恶性肿瘤、先天性疾病及血液系统非恶性肿瘤等疾病的治疗，尤其是造血干细胞移植治疗重型β-地中海贫血在国内外处于领先水平。目前每年完成儿童移植100余例，至2022年5月底已完成各类造血干细胞移植1361例。

2017年9月南方医院儿科团队荣获中国儿科医学最高奖项“宋庆龄儿科医学奖”。2017年儿科开展了脑瘤、神经母细胞瘤、淋巴瘤、肝母细胞瘤、肾母细胞瘤、骨肉瘤等实体瘤的实体瘤精准诊疗，率先在国内开展了脑瘤的自体干细胞移植支持下的强化疗及难治复发实体瘤的自体干细胞移植及靶向治疗，是国内少有的儿童脑瘤化疗单位。

南方医院儿科是广东省地中海贫血防治协会挂靠单位、广东省药学会儿童肾脏专家委员会主任委员单位、中国妇幼保健协会地中海贫血防治专业委员会主任委员单位、广东省儿童肾脏风湿疾病诊疗联盟副主委单位、广东省儿童哮喘标准化门诊授牌单位，广东省基层医院儿童哮喘规范诊治示范培训基地。

现有医护人员141人，医生51人，正高3人，副高6人，中级18人。博导2名，硕导3名，为博士、硕士学位授权点。床位107张，分成两个区，移植层流病区床位19张，普通病区床位78张、危急重症床10张。在科研上，获得国家级和省部级课题数十项，在国外权威杂志发表移植相关SCI论文数十篇。先后获国家自然科学基金项目、广东省自然科学基金项目、广东省卫生厅科技计划项目、军队“九五”青年基金项目，参与了国家863课题1项，开展国际合作研究2项，取得一系列研究成果。

儿科还与美国南加州大学洛杉矶儿童医院，CityofHope，哈佛大学医学院Brigham医院，英国谢菲尔德大学肾脏研究所，澳大利亚新南威尔士州大学儿童癌症研究院等知名大学医学院校建立长期稳定的合作关系，在国内外享有一定的声誉。