上海市公共卫生临床中心血液科（血友病感染科前身）为公卫中心感染一科之血友病合并艾滋病病房，主要收治血友病合并艾滋病患者。2004年11月医院总部迁至金山后，血液病合并艾滋病病房一直留守在中心市区分部，目前在治患者共70名。为更好地服务于患者，2012年6月20日，正式成立感染三科，属独立建制，2016年10月更名为血友病感染科，科室主要承担来自上海的全部血友病合并艾滋病患者的门诊和住院治疗工作。

作为上海市血友病合并艾滋病收治的唯一定点医院科室，在治疗艾滋病相关肿瘤、血友病合并艾滋病、艾滋病合并丙型肝炎治疗、ART药物不良反应的处理、艾滋病合并性传播疾病的诊治方面积累了丰富的临床经验，赢得同行和患者的认可。

同时科室代管中心性病科及承担全市职业暴露后的处理工作。性病科购置电子阴道镜、二氧化碳激光治疗仪、光动力治疗仪等先进仪器，在治疗艾滋病合并梅毒、尖锐湿疣、淋病、生殖器疱疹等方面有着丰富的临床经验；在HIV、梅毒、病毒性肝炎等职业暴露后的处理方面取得了“零”感染的佳绩，获得了良好的社会效益和相关职能部门的肯定。