中国医科大学附属第一医院感染病科分为感染性疾病一科和感染性疾病二科
感染性疾病一科
中国医科大学附属第一医院感染性疾病一科建立于1996年5月，先后获批国家卫健委“细菌真菌感染诊治培训基地”和辽宁省“感染性疾病医疗中心”，为“辽宁省医院感染管理质控中心”挂靠单位。多年来形成了医院感染诊断治疗与预防控制为一体的学科体系。

科室现有医护人员29人，其中教授3名、副教授7名，博士导师1名，硕士导师7名，编制床位42张。感染性疾病一科秉承“治感染表里兼顾/诊发热内外双修”业务要求和理念，拥有对各种感染性疾病（infectiousdisease），包括法定传染病（communicabledisease）的诊治能力。专注不明原因发热（FUO）的病因诊断、发生于院内外的各器官、系统复杂、难治和耐药菌感染的诊治；对抗生素合理应用具有相当造诣。
感染性疾病二科
中国医科大学附属第一医院感染性疾病二科为辽宁省高等学校重点学科，先后承担包括6项国家自然科学基金、1项卫生部临床重点项目等15项科研基金。近3年来发表传染病相关文章30余篇，SCI收录论文10余篇，获得省科技进步二等奖1项。临床上专注各种肝病、传染性疾病、重症感染的诊断治疗，尤其对重型肝炎的抢救治疗和危重传染病，特别是多器官功能衰竭的治疗有较深入研究。2020年通过国家审核成为国家传染病区域医疗中心。