上海交通大学医学院附属第九人民医院泌尿外科创建于1980年，经过4届科主任及全体泌尿外科人的40余年努力，现已发展成为集医疗、教学、科研于一体，亚专业齐全、学科特色鲜明、有一定学术影响力的泌尿外科。2015年10月上海交通大学医学院附属第三人民医院整建制并入上海交通大学医学院附属第九人民医院。泌尿外科作为第一批整合学科，组成了全新的泌尿外科，分为南北两部。目前泌尿外科是中华医学会男科学分会副主任委员单位，上海市医学会男科学分会副主任委员单位，中国男科手术培训中心，上海交通大学医学院重点学科，上海交通大学医学院附属第九人民医院重点学科，上海交通大学医学院前列腺激光微创诊治中心，上海交通大学医学院尿失禁及盆底重建诊治中心，泌尿外科肿瘤冷冻消融治疗上海培训基地(国际冷冻学会)，上海交通大学博士学位授予点，博士后流动站，上海市住院医师、专科医师规范化培训基地。曾获得了“上海市青年文明号”，"上海市卫生健康行业青年五四奖章集体”，"上海市卫生健康行业"青年文明号""上海九院2022年度文明科室”等荣管称号。同时，在最新一轮申康的上海市综合性医院泌尿外科专科能力评分中，科室名列第七。

科室现开放床位100张，年门诊80000人次，年出院人次7000余人次，年手术近8000人次;科在编医生35人均为硕士研究生以上学历，其中主任医师6名，副主任医师10名，博士研究生导师2名，硕士研究生导师3名，绝大数中青年骨干拥有博士学位和出国留学背景，且手术技能过硬。学科目前有独立的尿失禁及盆底重建诊治中心、体外震波碎石治疗室、尿流动力学检査室、男科疾病检査治疗室，配备大功率100W钬激光、第四代EMS超声碎石系统、体外震波碎石机、3D及高清腹腔镜、BK2202泌尿专科超声仪、东芝超声诊断仪和伟力男科工作站、盆底康复仪等众多大型医疗设备，仪器设备总值达3000余万元。目前科室设有前列腺疾病、尿路修复重建、泌尿系肿瘤微创、男科学泌尿系结石及女性泌尿外科/盆底专业6个亚专业治疗组。在前列腺增生及前列腺癌的微创诊治、严重的泌尿男性生殖器畸形/外伤/肿瘤等创面修复重建、泌尿系肿瘤及结石的微创诊治等方面具有特色，诊治范围涵盖了几乎所有的泌尿外科和男科疾病。

在新一届科主任徐斌教授领导下，科室在达芬奇机器人手术、泌尿系统肿瘤冷冻消融治疗、氩气刀免缝合精准保肾手术等方面开展了大量创新性工作。目前已完成达芬奇机器人手术超过500台。除了常规开展机器人辅助前列腺癌根治术、肾部分切除术、全膀胱根治性切除术、输尿管修复重建术等手术外，在国内率先开展达芬奇机器人单孔途径保留尿道的前列腺切除手术(Madigan)，有效保留前列腺增生患者术后射精功能。同时，作为国内首批完成多项单孔机器人手术的单位参加首台国产纯单孔术锐机器人手术系统研发的多中心临床研究，并于2022年9月17日在九院发布研究结果。泌尿系统肿瘤冷冻消融治疗方面，在国内率先完成多项泌尿系统肿瘤冷冻消融术，包括单孔腹腔镜经腰及经脐途径肾癌冷冻消融术、CT引导下经皮穿刺肾肿瘤冷冻消融术、超声引导下经会阴前列腺癌氩氮刀冷冻术，同时发表了多篇冷冻相关论文，相关经验收录进第8版《黄家驷外科学》:设计发明国内首个前列腺介入治疗模板，获专利授权1项;在上海市科委的资助下完成肾肿瘤氩氮刀冷冻消融标准研究，牵头完成并发布《肾肿瘤冷冻消融围手术期管理专家共识2022版》(《中华内科学杂志》2023)氙气刀免缝合精准保肾手术方面