焦作市第二人民医院病理科是焦作市医学重点（培育）学科、分子病理医学重点实验室，集医疗、教学及科研于一体，作为焦作市病理质控中心、焦作市基因与细胞工程中心、河南省靶向基因检测中心焦作分中心的挂靠单位，还承担焦作市各级医院的病理质量控制工作、疑难病理会诊工作、焦作市肿瘤基因检测、焦作市法医病理学及司法临床病理鉴定工作、高校病理学教学工作和病理学基础研究工作。科室现有工作人员25人，其中高级职称3人，中级职称6人，硕士研究生6人，在读博士研究生2人，兼职博士、教授3人，在研省级科研项目4项。科室目前开展脱落细胞学、穿刺细胞学、液基细胞学、细胞石蜡包埋、肿瘤细胞体外培养及药敏、常规病理、快速石蜡、术中快速冰冻、组织化学、免疫组织化学、荧光原位杂交、分子病理学、法医尸检等检查项目。分子病理实验室成立于2014年，引进包括PyroMarkQ24DNA测序仪、Rotor-GeneQ实时荧光定量PCR分析仪等在内的基因检测相关设备，并于2015年7月投入使用，开展的肿瘤靶向、化疗及其它多种药物敏感性检测为患者药物精准治疗提供了强有力的支持。分子病理实验室于2019年获批为焦作市医学重点实验室，推动了病理学技术科研水平的提高。焦作市基因与细胞工程中心是在焦作市卫健委推动下，由焦作济士源医学检验所和焦作市第二人民医院共同建设，预算投资约6千万元（根据发展情况进一步开展肿瘤免疫研究、肿瘤生物样本库建设、成立院士工作站等后续建设），由病理科管理。引进包括DA8600高通量基因测序仪、ABI7500实时荧光定量PCR仪等在内的基因检测相关设备。曹开源教授领队包括中山大学、达安基因、广州济士源的6名教授、博士定期来中心指导工作。2019年11月，病理科分子病理实验室和焦作市基因与细胞工程中心联合焦作市分子病理、妇科肿瘤、肺部肿瘤、肿瘤转化等四个医学重点实验室开展临床及科研工作，迈出了从临床向科研的重要一步。