复旦大学附属儿科医院传染感染科作为上海市儿童传染病唯一定点救治单位，在上海市儿童相关突发传染感染病应对中，发挥专业主导作用。在应对2003年的SARS、2008年的手足口病、2009年的新型甲型H1N1流感、2011年猩红热暴发以及2013年人感染禽流感H7N9、季节性流感暴发以及2020年的新冠肺炎等公共突发事件中，均出色地完成了临床救治防工作；同时参与国家各类应急及突发传染病救治决策方案的制定、会诊等工作，承担全国和上海市儿童疫苗接种异常反应和特殊儿童疫苗接种的专家咨询和指导工作，为国家小儿传染病疫情报告、传染病防控和诊治、儿童疫苗接种提供了重要的数据和建议。传染感染的专业科研工作从重症传染病的治疗和抢救逐渐扩展到感染性腹泻病、乙肝疫苗及HBV母婴传播的阻断的研究、手足口病、麻疹、流感、EV71、猩红热、重要新发和突发传染病、特殊人群疫苗接种、细菌耐药和抗生素合理使用感染病相关的各个方面。儿童肝病中心成立于2005年9月，在国际上率先鉴定了MYO5B缺陷、USP53缺陷、ZFYVE19缺陷等引起的婴儿胆汁淤积症，以及RINT1突变引起的发热相关反复肝功能衰竭，使我国遗传性肝病诊疗工作达到国际先进水平。中心对各种罕见、少见、疑难肝病的诊断水平国际先进，肝移植的开展更使综合治疗水平国内领先，服务全国儿童肝病诊治。人才梯队感染传染科有专科医师28名，80％以上具有博士学位，主任医师5名、副主任医师6名。护师/士25名，其中主任护师1名，主管护师4名。博士生导师3名，硕士生导师2名。闵行区领军人才2名。获奖情况1998年上海市科技进步二等奖2003年上海市科技进步三等奖2017年中国儿科医师终身成就奖（朱启镕）2017年上海市科技进步三等奖2018年华夏医学科技三等奖2022年上海市工人先锋号2022年上海市医学科技三等奖全国抗击新冠疫情先进个人全国抗击新冠疫情三八红旗手