河南省儿童医院消化内科是河南省医学重点学科、郑州市医学重点学科，拥有郑州市儿童消化病重点研究实验室。河南省医学会儿科分会消化学组组长单位、中国医师协会基本消化内镜培训基地、儿童肝病精准诊疗成员单位。开放床位110张，在郑东院区、东三街院区开设消化专业病区，科室专业技术实力雄厚，拥有OLYMPUS电子内镜系统、PENTAX电子内镜系统、Fuji-film电子内镜系统、胶囊内镜无线监测系统、C13幽门螺杆菌检测仪、食道阻抗-pH联合监测系统、食管测压仪肛门直肠测压仪等先进仪器，开展儿童消化系统相关的各种疾病诊治。