上海交通大学医学院附属新华医院新生儿科是国家重点学科、国家“双一流”建设学科，是国家新生儿保健特色专科、国家儿童早期发展示范基地，国家新生儿和围产专科医生培训基地，是中华医学会围产医学分会前任主委，上海医学会儿科分会候任主委，新生儿学组组长单位，也是上海市危重新生儿会诊抢救中心。床位100张，其中NICU60张，Maternal-NICU 5张，家庭亲子病房12张。有博士生导师2名，硕士生导师4名。诊治技术新华医院新生儿科拥有国际一流的专业抢救设备，可开展体外膜肺（ECMO）、床边支气管镜检查、持续肾脏替换治疗（CRRT）、腹膜透析和持续脑功能监护等先进技术。新生儿科对于各种胎儿疾病，遗传性疾病，重症感染，脑膜炎，支气管肺发育不良、婴儿肝炎、早产儿视网膜病和营养性疾病有丰富经验，同时与兄弟科室合作，形成“产婴一体”、“多学科合作”医疗组，救治大量先天性膈疝、食道闭锁、危重先天性心脏病、重症脑积水、上气道梗阻、胆道闭锁患儿。特色服务危重新生儿主动转运开展泛长三角地区各种危重、疑难疾病新生儿的主动转运。2018年，开通首个长三角危重新生儿空中转运通道，胎龄26周龙凤胎从淮安直升机转运获救。亲子家庭病房新生儿科配置了12张亲子家庭病房，在常规诊疗工作基础上，提供喂养指导和早期发展等培训，减少母子分离，促进新生儿生长发育。多学科大查房新生儿科对疑难病例、危重病例实行多学科大查房制度，疾病所涉及的相关科室专家参与患儿诊疗过程，共同为患儿制定最佳的个体化治疗方案。多学科联合门诊新生儿科联合儿童康复科、儿童保健科和营养科建立“高危儿随访联合门诊，促进高危儿的体格、运动、语言、认知和社会情绪等达到最佳发育水平。联合中医科、儿童保健科开设“喂养和生长发育中西医联合门诊”，联合儿消化科、儿呼吸科开设“婴幼儿过敏与成长联合门诊”，有效改善其体格和智力发育。