上海交通大学医学院附属新华医院小儿泌尿外科专业是国内首批建立的小儿外科亚专业。早在1958年新华医院创建之初，李衷初教授就创立了小儿泌尿外科专业组，历经李衷初教授、刘国华教授、陈方教授和徐卯升教授等几代带头人的创新、传承、再创新，该科室在医疗、教学、科研方面始终居于国内前列，是中国国家卫生与健康委员会唯一的儿童结石病诊疗中心，是国家“211工程”建设重点学科和上海市重中之重学科的重要组成部分，是国家卫健委临床重点专科，隶属于上海市临床医学中心——小儿外科畸形矫治中心。目前科室拥有住院床位41张，博士生导师1名，硕士生导师1名，主任医师2名，副主任医师1名，主治医师2名，住院医师及研究生若干。科室主要临床方向均处于国内领先水平：①儿童泌尿生殖器畸形：尿道下裂作为小儿泌尿系最常见的先天性畸形之一，占小儿泌尿外科专业组住院手术数近1/3，上世纪70年代李衷初教授提出的“膀胱粘膜代尿道”得到了国内外同行的肯定；90年代初刘国华教授率先在国内开展了“Onlay术式”；90年代末陈方教授率先在国内开展了“Snodgrass术式”，使尿道下裂的治疗始终处于国际同步，国内领先的地位。②儿童上尿路畸形：该中心收治的上尿路畸形患儿病例数位居全国前列，在肾积水的小切口手术治疗及微创治疗上，手术例数及成功率始终处于国内领先的水平。在国内首次提出经腹股沟小切口膀胱外输尿管再植手术治疗儿童肾重复畸形，该手术方法疗效显着，创伤小，目前已在国内多中心普遍推广。③儿童尿路结石：每年单中心诊治的儿童泌尿系统结石100余例，可常规开展体外震波碎石、输尿管硬镜碎石、输尿管软镜碎石以及经皮肾镜碎石等微创治疗技术，已完整建立起儿童泌尿系统结石代谢评估、分子病因诊断及综合治疗体系，使得儿童尿路结石的综合处理能力处于国际先进水平。④儿童输尿管反流：在国内较早开展Lich-Gregoir手术方式治疗儿童原发性膀胱输尿管返流，其手术病例数及治疗效果等均处于国内领先地位。同时作为国内三家儿童泌尿外科中心之一参与Deflux治疗儿童原发性膀胱输尿管反流的临床实验。