衣原体检测的方法如下： 1、一般检测：有抗原检测、酶联免疫吸附试验，即平常说的ELISA方法。检测临床标本中衣原体抗原该方法敏感、简便快速，但与细菌有交叉反应，可出现假阳性，尤其是鼻咽部标本； 2、核酸检测：即使平常说的PCR方法，用于检测衣原体的DNA，能从标本中直接鉴定衣原体的种和型别； 3、抗体检测：生殖道感染无并发症患者可产生低度的抗体，约20%的急性衣原体尿道炎患者不产生抗体。常用的方法有补体结合试验、微量间接免疫荧光试验、直接荧光抗体等方法。

沙眼衣原体感染引起结膜炎、肺炎，以及泌尿生殖系统感染。但这三种疾病临床缺乏特异性，因此临床需要检查沙眼衣原体。检查沙眼衣原体的方法有血清学还有病原学，通过这两种检测手段，检测出沙眼衣原体，以进一步诊断是否有沙眼衣原体引起的结膜炎、肺炎和泌尿生殖道系统感染疾病。新生儿衣原体肺炎，多发生在出生后4-11周，如合并包涵体性结膜炎，则高度提示为沙眼衣原体感染，应及时进行病原体检查，并排除其他细菌、病毒或支原体等感染。

病原衣原体主要有肺炎衣原体、沙眼衣原体、鹦鹉热衣原体，前两者临床最常见。肺炎衣原体被认为是引起肺炎、支气管炎及其他呼吸道感染的常见病原菌。沙眼衣原体除可导致沙眼外，还是公认的性疾病传播的传染源之一。在非淋菌性尿道炎中，几乎一半是由沙眼衣原体感染造成的，其可引起尿道综合征和性病淋巴肉芽肿，男性尿道炎、附睾炎，女性不孕、子宫颈炎、盆腔炎等。新生儿通过产道感染，可引起新生儿眼炎或新生儿肺炎。沙眼衣原体还可以引起成人肺炎，对孕妇危害也较大，可造成宫外孕、流产、死胎、绒毛膜羊膜炎、早产等。鹦鹉热衣原体可引起鹦鹉热，是人类吸入受感染的鸟排泄物的尘粒而感染，发病时常有高烧、头痛、肌肉痛、寒战和上下呼吸道不适，部分患者可并发脑炎、心肌炎或血栓性静脉炎。