随着医学影像学的不断发展，磁共振在临床上应用越来越广泛，可以从头到脚都可以检查。例如头部可以检查先天性颅脑发育异常、脑积水、脑萎缩、脑血管疾病、颅内肿瘤和感染、颅脑外伤等。还有眼部的病变，例如眼眶前病变、眼外肌病变、视神经病变、眼球病变等，鼻咽部及喉部的良性恶性病变，口腔及颌面部的病变。肺部的病变纵隔及肺门、胸腔与胸壁、乳腺、心脏及大血管的病变。腹腔病变如肝脏、胆系、胰腺、脾脏的原发性或转移性肿瘤以及先天性病变。肝寄生虫以及胆道梗阻、肝脓肿、炎性假瘤、胰腺炎及其并发症。盆腔病变如膀胱、输尿管、前列腺、精囊腺、子宫、卵巢及其附件的病变，盆腔及其脏器的损伤，肾脏及肾上腺的病变。脊柱的病变如椎管内肿瘤，脊髓病变，脊柱及脊髓外伤性病变，脊柱及脊髓的先天性病变，椎间盘突出、椎管狭窄、骨关节及肌肉病变等等。

检查磁共振的痛苦，无论是头部或是身体的其他部位，所谓的痛苦实际都是一样的，只是由于个体差异对这种痛苦的感受不一样，做磁共振产生的痛苦，并不是肉体上的感受，而是来源于精神层面的痛苦，这种痛苦来自于磁共振狭窄的检查舱。检查舱使人感到幽闭、呼吸不畅的感觉。另外，机器在运行时发出了长时间刺耳的噪音，也会让多数人感到难以忍受，精神上会感到非常的痛苦。

磁共振在临床上的应用，有着不可替代的地位，应用非常广泛。磁共振仪器检查本身，对人体没有任何伤害，但是在做磁共振检查时，特别是头部检查，病人的头部及上半身几乎都在一个狭小的检查舱内，由于空间狭窄而且低矮，使人会感到一种封闭和压迫的感觉，呼吸也感到十分不通畅，特别是在磁共振工作时噪音非常大、震耳欲聋，让人感到特别烦躁，实在是难以忍受，但对身体并无大碍。

磁共振与CT不是一回事，无论是工作原理还是检查范围都是不一样的，但是二者都是影像学诊断设备，但是他们存在着很大的差别。 首先磁共振是利用人体内氢原子核在磁共振仪器的磁场作用下，产生共振，在经过一系列的电子计算机处理和数字重建技术转换成磁共振图像；而CT是利用X射线成像的原理形成图像的。 其次，二者在疾病的主要检查方面也是不同的。例如磁共振对软组织滑膜、肌肉、肌腱、韧带等检查具有较高的诊断率；而CT则在观察骨头、出血、肿瘤方面比较具有优势。然后如果长时间的做CT对人体是有一定辐射的，而磁共振是没有辐射的。

磁共振的工作原理，简单的讲，人的身体的主要成分80%是水，水中的氢原子就是人体内数量最多的物质，每个氢原子都带有一个氢原子核，而磁共振诊断仪能够使某一组织或部位的氢原子核，在强大的磁场空间内产生共振，使原来杂乱无章的氢原子核一起按外磁场方向排列并运动。当立即取消外磁场磁力后，人体内的氢原子会在相同的组织、相同的时间下回到原状态，整个过程通过计算机系统采集这些信号，在经过数字重建技术转换成磁共振图像，用来临床诊断。

磁共振和CT就对人体的辐射而言，显而易见，磁共振是没有辐射的，因为磁共振是利用人体内的氢原子核，在磁共振仪器的强大磁场空间内产生共振与还原的过程，而释放出的能量信息，通过高能的电子计算机系统采集这些信号，再经过数字重建技术转换成磁共振的图像。CT的工作原理的本质是利用X线成像，因此其对人体的伤害，也就是X线电离辐射对人体的伤害，所以做CT检查对人体还是有一定辐射的，因此CT一年检查最好不要超过2-3次。

磁共振仪器检查本身对人体以及器官没有任何伤害，也就是说对于肝脏没有什么损伤。无论做什么检查，在做磁共振时，因为检查舱的空间比较狭窄，而且低矮，让人会感到一种封闭的感觉，使人有点感到非常窒息。特别是在检查过程中磁共振的机器工作时噪音非常大，让人难以忍受，有一种非常烦躁的感觉，这种感觉不是疼痛，而是痛苦。所以磁共振检查对肝脏并没有什么影响，但是会感到非常痛苦。

目前，磁共振在医学影像学当中有着不可替代的地位，磁共振的应用范围非常广泛，可以说能够进行全身的各个器官疾病的检查。在进行磁共振检查时，是否需要空腹取决于需要检查的部位，如果是检查头颈部、胸部以及四肢等就不需要空腹，而在检查腹部的肝、胆、胃肠、胰腺等器官时是需要空腹的。因为食物在胃肠道内，无论是食物本身，还是食物所产生的气体都可能会在检查中形成伪像，会影响正常的诊断。

核医学科检查是利用核素的放射性来进行器官的功能测定，比如常用的骨扫描、甲状腺静态显像、肾动态显像等等，核医学科检查都是要利用到核素的放射性的，放射性或多或少都会对人体有一定的影响，但是核素的放射性都在控制的范围之内，不会对人体有大的影响。同时进行检查完毕之后，进行一定的预防措施，可以减轻对人体的影响，比如骨扫描后可以适当大量饮水、多排尿，加快核素的排泄，减少核素在人体内的滞留对人体产生的影响。