男性性疾病全套检查费用因医院级别、地区发展水平及检查项目而异，基层医院约500-1000元，二级医院800-1500元，三甲医院1000-2000元；经济欠发达地区500-1200元，发达地区1500-2500元。
1、医院级别：
- 基层医院：设备相对简单，检查项目可能相对较少，男性性疾病全套检查的费用可能在500-1000元左右。
- 二级医院：医疗条件稍好，检查费用会相对高一些，大概在800-1500元。
- 三甲医院：设备先进、技术成熟，检查结果更准确，但费用也较高，全套检查可能在1000-2000元。
2、地区发展水平：
- 经济欠发达地区：消费水平较低，人力成本、医疗成本等也相对较低，男性性疾病全套检查的费用可能在500-1200元。
- 经济发达地区：如一线城市，各项成本较高，检查费用会相应增加，可能在1500-2500元。
3、检查项目：
- 尿常规检查：可了解是否伴有普通细菌感染等情况，费用一般在20-50元。
- 淋球菌检查、细菌培养：用于淋病的检测，检查费用大概在100-200元。
- 支原体、衣原体检查：这是常见的性传播疾病病原体检查，费用在150-300元。
- 梅毒螺旋体抗体血清学检查：包括初筛试验和确诊试验，初筛试验费用在50-100元，确诊试验费用在100-200元。
- 艾滋病抗体检查：如果进行的是艾滋病抗体检查，一般费用在50-100元。
- 影像学检查：如果怀疑有尖锐湿疣等病变，可能需要进行醋酸白试验，费用较低，通常在50元左右；但如果进行HPV基因分型检测，费用可能在200-300元。
需要注意，具体费用还会因医院的具体收费标准以及患者的具体情况而有所不同，如果有相关需求，建议到当地医院咨询具体费用。
男性性疾病全套检查的注意事项
- 避开身体不适如感冒、发烧等时期，进行血液检查时需早上空腹，提前禁食禁水，检查前一天清洗外生殖器，用温和清洁剂，避免刺激，提前2-3天避免性生活及自慰。
- 检查中配合医生，如实告知症状、病史及性生活情况，检查时放松心情，配合操作，进行特殊检查时保持安静。
- 检查后及时领取并读懂检查报告，有疑问向医生咨询，保持联系畅通，若结果异常，遵医嘱治疗，按时服药复查，注意个人卫生，疾病未愈前避免或采取安全措施性生活。