头皮毛囊炎的治疗应根据感染类型选择适当的药物，细菌感染者外用莫匹罗星软膏或夫西地酸乳膏，真菌感染者则推荐酮康唑洗剂或伊曲康唑胶囊。综合治疗，可以缓解症状，促进康复。
1、莫匹罗星软膏：作为局部外用抗生素，莫匹罗星软膏对于革兰阳性球菌引起的皮肤感染，如毛囊炎，具有显著的抗菌效果。
2、夫西地酸乳膏：夫西地酸乳膏适用于多种细菌感染引起的皮肤感染，包括毛囊炎。能够有效杀灭细菌，促进皮肤修复，加速愈合过程。
3、酮康唑洗剂：对于真菌感染引起的头皮毛囊炎，酮康唑洗剂能够抑制真菌生长，减轻头皮瘙痒和炎症，预防病情反复。
4、克林霉素甲硝唑搽剂：不仅针对细菌感染有效，还能在一定程度上抑制真菌生长。适用于混合感染或病情较为严重的头皮毛囊炎患者。
5、伊曲康唑胶囊：对于真菌感染引起的头皮毛囊炎，伊曲康唑胶囊是有效的口服抗真菌药物。能够深入体内，杀灭真菌，防止病情扩散。
在使用药物治疗头皮毛囊炎时，务必遵循医嘱，按时按量用药，注意保持头皮清洁，避免搔抓患处，以免加重感染。饮食宜清淡，避免辛辣刺激性食物，以免影响药物疗效或加重病情。如症状持续不改善或加重，应及时就医。在恢复过程中要注意定期到医院复查，以便医生及时调整治疗方案。