口腔溃疡伴随着喉咙痛可能由疱疹性咽峡炎、手足口病、白塞病、急性扁桃体炎、复发性口腔溃疡并发咽炎等引起，治疗方法因病而异，需要明确病因，采取适当的治疗措施，以缓解疼痛，促进恢复。
1、疱疹性咽峡炎：由肠道病毒引起，除了口腔溃疡，喉咙疼痛剧烈，吞咽时加重，还可能有发热、乏力等全身症状。喉咙可见多个小疱疹和溃疡。治疗方法主要是休息、多饮水，并保持口腔清洁，可用淡盐水漱口。
2、手足口病：肠道病毒感染所致，除了口腔和喉咙的症状，手、足、臀部等部位会出现皮疹或疱疹，口腔溃疡疼痛明显，影响进食。喉咙痛，吞咽困难。治疗重点是隔离休息，注意口腔和皮肤护理。保持室内通风，避免交叉感染。
3、白塞病：属于自身免疫性疾病，口腔溃疡反复发作，伴有喉咙痛，还可能有眼部炎症、皮肤损害等症状。治疗包括局部对症治疗，如遵医嘱使用糖皮质激素软膏缓解口腔溃疡症状。病情严重的患者，可能需要遵医嘱使用免疫抑制剂进行系统治疗。
4、急性扁桃体炎：细菌或病毒感染扁桃体，喉咙疼痛明显，吞咽时疼痛加剧，可放射至耳部，且扁桃体红肿，表面可能有脓性分泌物，还可能同时存在口腔溃疡。治疗主要是针对病原体进行治疗，如遵医嘱使用抗生素或抗病毒药物。
5、复发性口腔溃疡并发咽炎：口腔溃疡反复发作，伴有咽部炎症。喉咙干痒、疼痛，有异物感。治疗方法包括调整饮食，避免辛辣刺激性食物，并保持口腔卫生，可使用含漱液漱口。若症状严重，可进行局部的物理治疗，如激光照射。
患者避免自行使用未经证实的偏方或药物，以免加重病情。注意戒烟限酒，避免对口腔黏膜和咽喉造成进一步刺激，保持良好的心态，积极面对疾病，有助于康复。