内生肌酐清除率即Ccr，使用标准24小时留尿计算法，Ccr(ml/min)计算公式为尿肌酐浓度(μmol/L)×每分钟尿量(ml/min)/血浆肌酐浓度(μmol/L)。还有血肌酐计算法，Ccr(ml/min)=(140-年龄)×体重(kg)/72×血肌酐浓度(mg/dl)，此为男性。Ccr(ml/min)=(140-年龄)×体重(kg)/85×血肌酐浓度(mg/dl)，此为女性。
成人正常参考值为80-120ml/min，老年人随年龄增长，有自然下降趋势。使用西咪替丁制剂、甲氧嘧啶制剂以及长期限制剧烈运动等，均会使Ccr下降。
肌酐是肌酸的代谢产物，人体血液中肌酐的生成可有内、外源性两种，如在严格控制饮食条件和肌肉活动相对稳定的情况下，血肌酐的生成量和尿的排出量较恒定，其含量的变化主要受内源性肌酐的影响。
而且肌酐的相对分子质量为113，大部分从肾小球滤过，不被肾小管重吸收，排泌量很少。故肾脏在单位时间内把若干毫升血液中的内在肌酐全部清除出去，称为内生肌酐清除率，可通过上述方式进行计算。