孩子身高矮小可以做骨龄检查、体格检查、内分泌检查、影像学检查、实验室检查等，来明确是什么原因导致的孩子身高矮小。
1、骨龄检查
是身高矮小患者常常需要进行的检查项目之一。可以通过拍左手正位片了解骨龄情况，评估孩子的骨骼发育程度，了解与实际年龄是否相符；
2、体格检查
包括测量身高、体重、头围、四肢长度、手指比例等指标，以评估孩子的生长发育状态，医生可以通过这些指标初步了解孩子身高矮小的原因；
3、内分泌检查
内分泌系统包括了许多重要的激素，如生长激素、甲状腺素等。导致孩子身高矮小最常见的是生长激素缺乏症，生长激素缺乏症可引起孩子身材矮小，但是智力正常。一些垂体的疾病也可引起生长激素分泌异常；
4、影像学检查
一些情况下，可以通过骨骼X光检查、MRI或CT扫描，以排除其他骨骼或器官异常；
5、实验室检查
包括血常规、尿常规、便常规、肝肾功能、血脂、乙肝五项、甲状腺功能、促肾上腺皮质激素、钙磷等离子、胰岛素等检查，以排查可以引起身材矮小的疾病。
如果孩子出现身高矮小的症状，应及时就医，通过检查明确病因，遵医嘱进行治疗。