儿童良性癫痫和普通儿童癫痫在脑电图上存在背景活动差异、癫痫样放电特点、发作期表现不同和预后判断差异等，通过脑电图检查可以为诊断和治疗提供重要依据。
1、背景活动差异：儿童良性癫痫患者的脑电图背景活动通常正常，与正常儿童相比无明显异常，普通儿童癫痫患者的脑电图背景活动可能出现不同程度的紊乱，如慢波增多、节律不规则等，这种背景活动的差异可以为医生提供一定的诊断线索，但不能仅凭此确定癫痫类型。
2、癫痫样放电特点：儿童良性癫痫的癫痫样放电具有特定的特点，通常表现为双侧中央颞区棘波或尖波，放电较为局限且有明显的睡眠相关性。普通儿童癫痫的癫痫样放电形式多样，可出现在大脑的不同部位，且不一定与睡眠相关。
3、发作期表现不同：在癫痫发作期间儿童良性癫痫患者的脑电图表现相对较为典型，发作时可见特定区域的电活动异常增强，随后迅速恢复正常。普通儿童癫痫发作期的脑电图变化则较为复杂，不同类型的癫痫发作表现各异，难以一概而论。
4、预后判断差异：通过脑电图检查，医生可以对儿童良性癫痫和普通儿童癫痫的预后进行一定的判断。儿童良性癫痫患者的预后较好，随着年龄的增长，癫痫发作可能逐渐减少甚至消失。普通儿童癫痫的预后则取决于多种因素，包括病因、发作类型、治疗效果等。
儿童在进行脑电图检查前应保持良好的睡眠和饮食状态，检查时要尽量放松，避免紧张和焦虑，如果孩子正在服用抗癫痫药物应告知医生。