胃窦糜烂的自愈能力因病因、病情严重程度等因素而异，轻度糜烂及药物性糜烂在调整饮食或停药后有可能自愈，而幽门螺杆菌感染及肿瘤性糜烂，不能自愈，需正规治疗方可控制病情。
1、轻度糜烂：对于由饮食不当或轻度刺激引起的胃窦糜烂，通过及时的饮食调整，如减少辛辣、油腻食物的摄入，增加清淡、易消化的食物比例，以及保持规律的作息和充足的休息，部分患者的糜烂情况有可能自行缓解甚至痊愈。
2、药物性糜烂：若胃窦糜烂是由于服用某些损伤胃黏膜的药物，如解热镇痛药、抗生素等所致，及时停用药物并采取相应的胃黏膜保护措施，糜烂情况也可能逐渐改善。若药物损伤严重或持续存在，自愈的难度会增加。
3、幽门螺杆菌感染：幽门螺杆菌感染是导致胃窦糜烂的重要原因，仅通过饮食调整或停药往往难以自愈。必须采用正规的抗菌治疗方案，根除幽门螺杆菌感染，才能有效防止糜烂的进一步发展和复发。若不及时治疗，糜烂可能加重，甚至引发胃溃疡等更严重的疾病。
4、肿瘤性糜烂：胃窦糜烂有时可能与胃早期肿瘤相关，糜烂往往不能自愈，且可能伴有其他症状如持续性的上腹部疼痛、体重下降等，必须通过内镜检查、放大内镜检查甚至病理学检查等手段进行明确诊断，并根据病情制定相应的治疗方案。
面对胃窦糜烂，患者应保持警惕，及时就医检查明确病因。在日常生活中，注意饮食卫生，避免暴饮暴食和摄入刺激性食物，遵医嘱用药，避免滥用损伤胃黏膜的药物，定期复查胃镜，监测病情变化，保持良好的心态和生活习惯也是促进胃窦糜烂恢复的重要因素。