一般没有治疗肛周脓肿效果最好的消炎药，需要根据患者自身情况选择才比较好，一般头孢类、青霉素类、大环内酯类、喹诺酮类及四环素类药物均对肛周炎症有治疗效果，通过不同机制抑制病原菌感染，促进恢复。用药前应咨询医师，注意饮食与卫生。
1、头孢类药物：包括头孢克肟分散片、头孢拉定胶囊等，药物当中的成分可以破坏细菌细胞壁，抑制细菌感染，能够改善肛周炎症。
2、青霉素类药物：可遵医嘱使用阿莫西林胶囊、阿莫西林克拉维酸钾片等药物，属于半合成青霉素，对病原菌的感染有抑制效果，缓解肛周脓肿引起的肿痛症状。
3、大环内酯类药物：包括罗红霉素胶囊、克拉霉素片等，药物具有抗菌的效果，可以抑制病原菌感染，对严重肛周脓肿恢复有好处。
4、 喹诺酮类药物：常见药物有盐酸左氧氟沙星胶囊、诺氟沙星胶囊等，通过抑制细菌DNA旋转酶的活性，阻碍细菌DNA的复制，达到杀菌效果，促进肛周脓肿炎症好转。
5、四环素类药物：可遵医嘱使用米诺环素片、多西环素片等药物，具有杀灭细菌的作用，对细菌感染引起的肛周脓肿有治疗效果。
患者在用药前需要咨询医师，要明确药物治疗是否对症，预防药物副作用。同时在恢复过程中要注意避免饮食辛辣，还要在睡前清洗肛门，保证干净。