夫妻双方由于各种原因导致长期分居可能会造成许多不利后果，主要包括影响夫妻感情、不利于孩子成长、内分泌失调、性衰退、发生妇科疾病，以及发生前列腺疾病等。
1、影响夫妻感情
夫妻长期分居，减少了沟通与交流，缺乏对彼此的关心，性欲望长期无法得到满足，会使夫妻之间的感情逐渐淡漠，甚至可能会导致夫妻双方在外面寻找第三者，进而导致离婚；
2、不利于孩子成长
夫妻长期分居，孩子跟随其中一方生活，可能会导致孩子对于另一方的依赖性降低，不利于亲子关系。另外，缺乏父亲或母亲的照顾，可能会导致孩子出现自卑、叛逆等心理问题，不利于孩子的教育与成长；
3、内分泌失调
夫妻长期分居没有性生活，体内的荷尔蒙分泌减少，造成内分泌失调，容易出现心理问题，如精神倦怠、情绪低落、焦虑、失眠等，严重者甚至出现抑郁症等心理疾病；
4、性衰退
夫妻长期分居没有性生活，性功能会逐渐退化，性欲减退或丧失，男性可能会出现阳痿、早泄、精子质量下降等。女性可能会出现体胖、更年期提前、性功能障碍等；
5、发生妇科疾病
夫妻长期分居导致女性长期没有性生活，会导致出现许多妇科疾病。阴道不能受到充分的刺激会减少黏液分泌，从而降低其自净能力，病菌容易在阴道内大量繁殖，从而引起阴道炎、宫颈炎、盆腔炎等；
6、发生前列腺疾病
夫妻长期分居导致男性长期没有性生活，不能将前列腺液排出体外，较容易使细菌滋生繁殖，导致前列腺炎或者其他前列腺疾病，如前列腺增生、前列腺囊肿、前列腺结石等。
夫妻长期分居且没有性生活，应该尽快解决分居的问题，恢复和谐的性生活，确保夫妻关系、婚姻及家庭的稳定。如果暂时无法解决长期分居的情况，建议尽量增加见面的频率，多与对方、孩子进行沟通，维系感情。