一侧耳朵和眼睛疼，考虑可能由中耳炎、外耳道炎、偏头痛等因素所导致。建议可前往医院的耳鼻咽喉科就诊，根据具体病因在医生的指导建议下进行治疗。
1、中耳炎：多由上呼吸道受到溶血性链球菌的侵袭引起感染，或者有不干净的水进入耳道，诱发中耳炎。细菌侵害耳道黏膜，从而出现耳朵疼的现象，如果耳朵内疼的神经连接眼睛的神经，可能会导致上述现象，伴有耳痛、耳鸣、耳道溢液、听力下降等症状。可在医生的指导下使用盐酸洛美沙星滴耳液、头孢克肟分散片、罗红霉素胶囊等药物进行治疗；
2、外耳道炎：由于外耳道皮肤受到细菌病原体的侵袭感染，或者受到外力的作用导致耳道皮肤损伤等，耳道皮肤的抵抗能力也会出现下降，从而引起外耳道炎。炎症可能会刺激连接眼睛和耳朵的神经，从而导致上述症状，伴有外耳道瘙痒、分泌液增多的现象。可在医生的指导下使用氢化可的松乳膏、阿莫西林胶囊、氨苄西林胶囊等药物进行治疗；
3、偏头痛：多由于外部因素的刺激，如寒冷刺激，导致患者神经功能出现失调，从而引起偏头痛。由于偏头痛一般是头部一侧疼痛，所以可能 会出现上述症状。可在医生的指导下使用布洛芬缓释胶囊、盐酸普萘洛尔片等药物进行治疗。
建议在日常生活中注意耳部清洁卫生，避免经常挖耳朵，以免损失耳朵黏膜，出现红肿、疼痛等不适症状。