乙状窦手术因解剖位置特殊、毗邻重要结构，存在一定风险，但并非风险很大的绝对化结论，临床中通过术前精准影像学评估明确解剖关系、术者熟练运用显微操作技术、术后规范抗感染及并发症监测，可显著降低风险发生率。患者的风险高低与病情复杂度、个体解剖差异密切相关，术前需与医生充分沟通，权衡手术获益与风险，以制定最优治疗方案。
乙状窦位于颅后窝，毗邻小脑、脑干、面神经、听神经等重要神经血管结构，手术操作区域空间狭小，解剖关系复杂，这使得手术本身存在一定风险，但随着影像学技术的发展、显微神经外科技术的普及及术前评估的完善，多数风险可通过规范操作有效规避和控制。
术中最受关注的风险之一是血管损伤相关并发症，乙状窦是颅内重要的静脉窦，承担颅内静脉血回流功能，手术中若损伤乙状窦壁，可能引发静脉窦破裂出血，若止血不及时或处理不当，可能导致颅内血肿，压迫脑组织，进而引发颅内压升高、脑疝等严重后果。此外，乙状窦周围还分布着颈内动脉、椎动脉等重要动脉分支，误损伤可能导致致命性出血，这对术者的解剖熟练度和操作精准度提出了极高要求。
神经损伤风险也不容忽视，乙状窦毗邻的面神经负责面部肌肉运动，听神经维持听觉和平衡功能，小脑则调控躯体平衡与协调运动。手术过程中，若对这些神经结构造成牵拉、压迫或直接损伤，可能导致患者术后出现面瘫、听力下降、耳鸣、眩晕、行走不稳等症状。尤其是对于存在解剖变异的患者，神经与乙状窦的位置关系可能异常接近，进一步增加了神经损伤的潜在风险。
术后感染相关风险同样需要重视，乙状窦手术属于颅内相关手术，手术区域若被污染，可能引发颅内感染，如脑膜炎、脑脓肿等，这类感染病情进展迅速，若治疗不及时，可能导致患者出现高热、意识障碍，甚至危及生命。此外，部分乙状窦手术需涉及乳突等部位，术后还可能出现乳突炎、切口感染等局部感染并发症，影响术后恢复。
除上述核心风险外，还可能存在脑脊液漏、颅内压紊乱等其他风险，脑脊液漏多因手术中硬脑膜破损未完全修复所致，若脑脊液持续渗漏，可能增加颅内感染风险，还可能导致颅内压降低，引发头痛、恶心等症状；颅内压紊乱则可能源于静脉窦回流受阻、血肿压迫等因素，需术后密切监测并及时干预。