益生菌是对人体有益的活性微生物，可以改善肠道菌群平衡，增强肠道功能，通常建议饭后服用比较好，可以减少对胃肠道的刺激，空腹时胃酸浓度较高，可能削弱益生菌活性，故不推荐空腹服用。
益生菌，即有益于宿主健康的活性微生物，对于维护肠道微生态平衡、提升消化系统健康具有重要作用。进食后，胃酸浓度降低，此时服用益生菌，能减少胃酸对益生菌的破坏，能更好地与肠道上皮细胞接触，促进其定植与繁殖，从而更有效地调节肠道菌群平衡，
饭后服用还可减少益生菌对胃黏膜的直接刺激，降低患者出现腹胀、腹痛等不适的可能性。
服用益生菌时需注意水温不宜过高，一般控制在40℃以下，以免高温破坏益生菌的活性，应避免与抗生素同时服用，如果必须同时使用，建议间隔2-3小时，以免抗生素杀灭益生菌。由于药物的使用具有个体差异性，应严格在医生指导下服用，切勿盲目。