平行眼3D对眼睛存在一定伤害风险，主要与观看时长、频率及个体眼部状况相关，健康成年人短期偶尔观看通常无明显危害，但长期或频繁观看易引发视疲劳；青少年、老年人及眼部功能异常者风险更高，可能导致视力问题加重。建议控制观看时间，每30分钟休息5分钟，保持良好用眼环境，眼部不适时立即停止，以降低伤害风险。
平行眼3D是通过双眼自然平行注视，使左右眼分别接收3D图像的不同视角画面，经大脑融合形成立体视觉的观看方式，其对眼睛的影响需结合视觉生理机制分析。正常视物时，眼睛通过睫状肌调节晶状体屈光力，同时双眼视轴协同汇聚，以确保物像精准落在视网膜对应区域，而平行眼3D会打破这种自然调节与汇聚的平衡。
观看平行眼3D内容时，双眼需刻意保持视轴平行，放弃自然的汇聚反射，这会导致睫状肌与眼外肌处于不协调的紧张状态。对于调节功能正常的人群，短期观看可能仅出现眼部酸胀、干涩等疲劳症状，这是由于肌肉持续异常工作引发的生理性反应，通常在停止观看后休息数小时即可缓解，不会造成器质性损伤。
但对于眼部调节功能较弱的人群，如青少年、老年人或患有屈光不正且未矫正者，平行眼3D带来的伤害风险会显著升高。青少年眼球发育尚未完全，长期强迫双眼维持平行状态，可能干扰正常的视觉发育，导致调节痉挛，甚至诱发或加重近视度数；老年人则因睫状肌功能退化，难以适应这种异常视觉需求，易引发视物模糊、头痛等不适。
从长期影响来看，若频繁且长时间采用平行眼3D方式观看内容，会使双眼视功能的协调性受到破坏。眼睛长期处于调节与汇聚分离的状态，可能导致双眼视功能紊乱，出现复视、立体视觉减退等问题，严重时还可能引发斜视倾向，尤其是本身存在隐斜视的人群，这种风险更为突出，需特别警惕。