结膜炎患者去眼科医院就诊时，可以根据医院的科室设置和自身情况选择合适的科室，如眼表科或角膜病科、急诊科、眼睑病专科、小儿眼科等。
1、眼表科或角膜病科：在一些综合性眼科医院或大型医院的眼科中，可能会有眼表科或角膜病科等细分科室。这些科室专门处理与眼表相关的疾病，因此结膜炎患者可以优先考虑这些科室。
2、急诊科：如果患者的结膜炎症状严重，如伴有眼睛疼痛、视力下降等，或者怀疑是由外伤等原因导致的结膜炎，应及时到医院急诊科就诊，以便迅速得到处理。
3、眼睑病专科：对于由过敏性因素引起的结膜炎，如接触花粉、尘螨等物质后引发的结膜炎，患者可以考虑到医院的眼睑病专科就诊。该科室医生会针对过敏症状给出相应的治疗建议。
4、小儿眼科：对于儿童患者来说，由于其年龄较小且可能无法准确描述病情，家长可以选择带患儿去小儿眼科就诊。小儿眼科医生会根据患儿的年龄和病情特点给出适合的治疗方案。
在就诊过程中，患者应积极配合医生的检查和治疗建议，以获得最佳的治疗效果。