真菌培养需要多少天出结果不可一概而论，因为真菌的培养时间与细菌相比较长，可能是48h，有可能需要更久，应根据培养目的来决定培养时间。对于培养分离出的真菌都应认真对待，一旦发现真菌培养阳性，应立即去医院就诊。
1、培养48h出结果
鹅口疮、阴道炎及中段尿分离念珠菌使用的显色培养基，培养时应至少生长48h，不超过72h；
2、培养4周出结果
绝大多数的真菌应在培养4周后检出，如果无检出，方可认为培养阴性，阴性代表没有真菌感染；
3、培养8周出结果
如果怀疑有双相真菌感染，应培养8周方可报告。培养最初的2周应每2-3天观察1次，之后每周观察。
一般认为除了皮肤、毛发等浅部感染的真菌外，深部组织、器官及系统性感染的真菌等都视为深部真菌，包括念珠菌、曲霉、青霉、暗色真菌、双相真菌等。
深部真菌感染可呈局限性，亦可播散感染，通常较为危险，严重者可致命，因此深部真菌感染可称为侵袭性真菌感染。深部真菌的培养对于后续的鉴定、药敏、治疗等至关重要。