跖疣一般可以在医生指导下使用水杨酸软膏、维A酸乳膏、咪喹莫特乳膏、斑蝥素乳膏、氟尿嘧啶软膏，上述药物使用后能帮助疾病有所恢复，患病后可以先到医院诊断，然后选择比较适合的药物使用。
1、水杨酸软膏：使用后可以促进表皮剥脱发挥治疗作用，将水杨酸软膏涂抹在跖疣的位置，可以促进病变的组织脱落，还可以起到软化皮肤表层效果。
2、维A酸乳膏：维A酸是维生素A的衍生物，可促进表皮细胞更新，调节表皮细胞增殖和分化，使角质层细胞疏松而容易脱落，从而达到治疗跖疣的目的。
3、咪喹莫特乳膏：跖疣主要由人乳头瘤病毒感染引起，咪喹莫特虽然没有直接抗病毒的作用，使用之后可以通过诱导细胞因子激活免疫细胞，从而刺激机体识别病毒，对治疗跖疣的效果比较好。
4、斑蝥素乳膏：斑蝥素有辅助抑制人乳头瘤病毒的效果，而跖疣是人乳头瘤感染造成的，患者可以使用此类药物治疗。
5、氟尿嘧啶软膏：药物使用后可以阻止人乳头瘤病毒的复制和生长，从而达到控制疾病的作用，促进患者的症状好转。
跖疣除了可以使用药膏进行治疗外，也可以选择其他物理治疗方式，包括冷冻治疗、激光治疗、电灼疗法等，同样能够有效去除疣体。