临床并不存在褪黑素的12个副作用和危害这一说法。褪黑素作为一种人体可以分泌的物质，作为保健品有提高睡眠质量的作用，一般没有副作用和危害，但少部分人过量服用后可能会出现头晕嗜睡、戒断反应、睡眠节律紊乱、胃肠道反应，甚至影响生殖系统。
1、头晕嗜睡
褪黑素本身就有促进睡眠的作用，过量服用后可出现嗜睡现象，并且可能会降低睡眠质量，对清醒时的生活质量造成很大的负面影响；
2、戒断反应
由于褪黑素会改变患者的神经系统活动，停药后可能出现戒断反应，如头痛、头晕、困倦恶心等不适感；
3、睡眠节律紊乱
长期服用会影响机体本身褪黑素的分泌，导致人体自身的睡眠节律紊乱加重，可能导致神经衰弱，出现白天困倦、反应减慢等不适症状。对于特殊群体，如抑郁症患者，过量服用还会出现情绪低落等异常；
4、胃肠道反应
褪黑素在服用后可能出现一系列的胃肠道反应，包括腹痛、腹胀、腹泻、便秘等；
5、影响生殖系统
高剂量的褪黑素会造成低体温，增加泌乳素的释放，可能导致月经紊乱、闭经等 症状，严重时导致不孕，还可以降低男性性欲，延缓青少年的性成熟等，导致生殖功能较差。
目前，我国市场上含有褪黑素的保健品剂量不一，若不加判断则容易过量服用，需引起注意并在医生的指导下服药。