细菌和病毒是两类不同的微生物。细菌和病毒最明显的区别包括结构不同、生存方式不同、繁殖方式不同等。
1、结构不同：细菌具备完整细胞结构，有细胞壁、细胞膜、细胞质以及拟核（原核生物）或细胞核（真核生物），其内部含有各种细胞器，能独立完成多种生命活动。而病毒没有细胞结构，仅由核酸（DNA或RNA）和包裹在其外的蛋白质衣壳构成，极为简单，不具备细胞的复杂结构，也没有维持生命活动的细胞器。
2、生存方式不同：细菌生存能力较强，在自然界广泛分布，可在土壤、水、空气及各种物体表面存活，部分细菌还能形成芽孢，抵御恶劣环境。其能独立利用周围环境中的营养物质进行生长、繁殖。病毒则完全依赖活细胞，离开宿主细胞后就无法进行生命活动，只有进入宿主细胞，借助宿主细胞的物质和能量才能完成自身的复制。
3、繁殖方式不同：细菌主要通过二分裂方式繁殖，一个细菌细胞分裂为两个基本相同的子代细胞，繁殖速度较快，在适宜条件下，如营养充足、温度适宜，几十分钟就能繁殖一代。病毒繁殖方式独特，先将自身核酸注入宿主细胞，利用宿主细胞内的物质和能量，按照病毒核酸携带的遗传信息合成新的病毒核酸和蛋白质外壳，然后装配成新的病毒颗粒释放出来。
4、大小形态不同：细菌相对较大，一般在0.5-5微米，形态多样，有球状、杆状、螺旋状等。借助普通光学显微镜即可观察到。病毒则非常微小，多数直径在10-300纳米，需借助电子显微镜才能看到。其形态常见的有球状、杆状、蝌蚪状等。
5、对抗生素反应不同：抗生素是一类能够抑制或杀死细菌的药物，多数细菌对特定抗生素敏感。抗生素通过作用于细菌的细胞壁合成、蛋白质合成等环节，干扰细菌的正常生理功能，从而达到抑制或杀灭细菌的效果。但抗生素对病毒无效，因为病毒没有细胞壁等抗生素作用的靶点，且其生存方式与细菌截然不同。
此外，引发疾病特点也不同，细菌感染引发的疾病，症状通常与细菌在体内的生长繁殖及释放毒素有关，如肺炎链球菌引起的肺炎，患者会有高热、咳嗽、咳痰等症状。病毒感染引发的疾病，症状往往与病毒破坏宿主细胞以及机体免疫反应相关，像流感病毒引起的流行性感冒，除发热、咳嗽外，还伴有全身酸痛、乏力等全身症状，且病毒感染更易引发大规模流行。
细菌与病毒感染的检查项目
- 对于细菌感染，常采用细菌培养检查。采集患者的血液、痰液等标本，放置在合适培养基上，若有细菌生长，可观察其形态、特征，确定细菌种类，还能进行药敏试验，指导用药。血清学检测也是常用方法，通过检测血液中针对细菌的抗体，辅助诊断感染。
- 对于病毒感染，核酸检测应用广泛，如PCR技术，可检测标本中的病毒核酸，快速判断是否感染及病毒类型。血清学检测同样适用于病毒感染，通过检测抗体判断感染阶段。影像学检查，在病毒引发肺部感染等情况时，能帮助观察病变部位和程度。