卵裂期胚胎和囊胚是胚胎发育的不同时期，卵裂期胚胎是受精卵发育到第三天的胚胎，囊胚是受精卵发育到第五天的胚胎。临床上囊胚移植的成功率高于卵裂期胚胎，所以相比较囊胚移植比较好。
虽然卵裂期胚胎进入母体时间较早，但卵裂期胚胎的着床率比较低，而且不是所有的卵裂期胚胎都可以发育成囊胚。囊胚移植可以根据囊胚评级，选择质量较好的单个囊胚进行移植，降低多胚胎妊娠的发生率，减少多胎妊娠带来的风险，如难产、早产。而且相较于卵裂期胚胎，囊胚移植可以降低胚胎细胞的应激反应，囊胚移植的妊娠率、活产率高于卵裂期胚胎，所以有条件的女性，可以选择囊胚移植。
虽然囊胚移植的成功率比较高，但如果囊胚数量比较少，可以遵医嘱选择卵裂期胚胎，增加胚胎移植数量，避免出现无胚胎可移植的情况。