三级医院和三甲医院都是医疗机构的一种分类方式，区别主要体现在规模与设施、技术水平、学科建设、医疗服务质量以及科研与教学等方面。
1、规模与设施
三级医院通常包括一定的医疗服务层次，涵盖了基层医疗服务、县级医疗服务以及地市级医疗服务。而三甲医院是指三级甲等医院，是在三级医院中细分为三甲的医院，更强调的是医院自身在同级别医院中的排名和地位，是对医院整体实力的一种综合评价；
2、技术水平
三甲医院通常拥有更高的技术水平和更丰富的医疗资源，能够提供更为复杂和高难度的医疗服务，如器官移植、危重病救治等。而三级医院包含的范围较广，主要提供全面而常规的医疗服务；
3、学科建设
三甲医院在学科建设方面更为全面和先进，拥有更多的高级专家和学科带头人，能够提供更为专业和精细的医疗服务。而三级医院主要注重全面医疗服务能力的提升；
4、医疗服务质量
三甲医院在医疗服务质量方面要求更高，有着更为严格的医疗质量控制体系和标准，能够提供更为优质和高效的医疗服务。而三级医院则主要注重医疗服务的全面性和普及性；
5、科研与教学
三甲医院通常具有更强的科研与教学能力，能够承担更多的国家级和省级科研项目，并培养更多的医学人才。而三级医院则主要注重医疗服务能力的提升和区域性医疗中心的建设。
尽管三级医院和三甲医院这两个术语有时会被交叉使用，但实际上侧重点略有不同。前者更强调医院的服务层次和服务范围，后者则更注重医院自身的医疗水平和综合实力。
在医疗服务体系中，这两个层次的医院各自承担着不同的使命和职责，共同构成完善的医疗服务网络。患者可以根据自己的病情和需求选择合适的医院进行治疗。