小排畸检查的最佳时间根据不同的定义和检查目的而有所不同，一般来说，小排畸可以分为早期和晚期两个阶段进行。早期小排畸主要关注胎儿染色体异常的风险度，而晚期小排畸则更注重全面评估胎儿的健康状况。孕妇应根据自身情况和医生建议选择合适的时间进行检查。
1、早期小排畸：通常是孕11-13+6周，最佳时间是在孕12-13周。主要通过彩超检查胎儿颈项透明带（NT）的厚度，这是早期判断胎儿染色体异常风险度的重要指标。如果NT值大于2.5mm（或根据不同医院标准可能有所不同），则考虑患唐氏综合征等染色体异常疾病的风险较大，需要进一步进行无创DNA或羊水穿刺等检查确诊。
2、晚期小排畸：建议在孕26-32周，通常在孕27-28周进行较佳。在进行了大排畸（孕20-24周）的基础上，进行第二次全面的胎儿畸形筛查。检查内容与大排畸相似，包括胎儿全身各器官系统的发育情况，以排除可能存在的畸形。晚期小排畸有复核大排畸的作用，也有补充漏洞的作用，能够更全面地评估胎儿的健康状况。
小排畸检查是孕期重要的产检项目之一，建议孕妇按照医生的建议按时进行。检查结果需要结合其他临床 信息进行综合评估，不能仅凭一次检查结果就做出最终诊断。如果在检查过程中发现异常情况，应及时咨询医生并遵医嘱进行进一步检查或治疗。